克罗托内在1923年成立之初，参加了好几次低级别的联赛。第二次世界大战后，一个新的俱乐部取代了以前的旧俱乐部，并在意甲打拼了七个赛季。在1963年降级，并且回到丙级联赛长达14个赛季之久。
        1978年，意大利足球联盟重组，克罗托内被降级到乙级，并在第二年被宣布破产。在1984/85赛季，为了适应意大利足球的分类，克罗托内进行了重组，其名称也改为Kroton足球俱乐部。在1986/87赛季，重组后首次回到意甲，并在意甲打拼到1991年。克罗托内在新主席拉菲尔的带领下，连续获得晋升的机会，并在1997年和1998年意甲取得好成绩。近十多年间，俱乐部在意大利几级联赛中起伏，最终在2008/09赛季结束时晋升为乙级球队。
        2010年11月28日，曾经效力于切沃、巴勒莫以及都灵的中场球员科里尼将成为意乙克罗托内的新主帅。